冯契6岁入私塾，一年后父亲举债供其读小学。1928年考入浙江省立初级中学（今杭州四中），成绩优异，得到当时校长唐世芳先生赏识，一直资助其直至高中毕业。1931年考入浙江省立杭州高级中学，数学成绩特别突出，老师认为可以免修。曾在校刊上发表数学论文《三等分任意角之曲线解法》、随笔《妄想》及译文《牡蛎生珠》、《摇磨刀石》（译自《富兰克林传》）等。

1935年，参加大学招生考试。先是报考南开大学数学系（奖学金名额），被录取。后又报考清华大学哲学系（清寒公费生），也被录取（为当年清华新生中的第二名）。冯契最后决定进清华哲学系。

1939年在昆明西南联大复学，师从冯友兰、金岳霖、汤用彤等。1941年进入清华大学哲学部学习，导师为金岳霖。1943年完成研究生毕业论文《智慧》，后发表于《哲学评论》。

美国学者墨子刻（Thomas Metzger）：冯契及其弟子在中国形成了一个新的马克思主义学派。

杜维明：上海的一位学者冯契，思考能力强、对中国问题提出了相当突出的见解。……我认为冯契最大的贡献之一是“智慧说”，就是把儒家的修身哲学和马克思主义的社会实践结合在一起。

成中英：冯契先生的哲学是从现代中国的政治社会文化的冲击、变革及对其反思中提炼出来的。他的哲学思想不但具有丰富的时代精神与社会生活体验，更具有对自然与社会认识的反思与对此反思的智慧。

汤一介：冯契的许多关于中国哲学史研究的书，我都认真拜读过，对我的教学和研究都有很大的帮助。他的那篇刊于《哲学评论》的《智慧》对我启发最大，我走上哲学研究道路的原因之一就是此文对我的影响。……我所比较欣赏的，在1949年之后又两个学者，一个是费孝通，第二个是华东师大的冯契。

1981年12月，经国务院学位委员会批准，冯契成为首批中国哲学史专业博士生导师。同年，入选国务院学位委员会哲学学科评议组成员（其他成员包括：王玖兴、任继愈、朱光潜、孙叔平、李泽厚、肖前、周礼泉、金岳霖、赵风岐、高清海、黄枬森）。

1985年3月，中国哲学史讨论会在庐山召开，专题讨论冯契所著《中国古代哲学的逻辑发展》（上、中、下）。该书后来被列为全国高等学校文科教材。1989年，《中国近代哲学的革命进程》出版。这两部著作完整地勾画了两千多年中国哲学的发展历史。1986年主编《中国近代哲学史》（上、下卷）。1992年主持编写《哲学大辞典》，该书获得首届“国家图书奖”提名、上海哲学社会科学优秀著作一等奖（1986—1994）。

冯契担任主编的还有：《中国哲学史纲要》（上海人民出版社，1979年）、《马克思主义原理教程》（上海人民出版社，1988年）、《中国历代哲学文选》（上海古籍出版社，1991年）、“真、善、美丛书”（华东师范大学出版社，1987年后陆续出版）、“中国近代社会思潮研究丛书”（上海人民出版社，1991年后陆续出版）等。此外，他还主持了一些师友的旧稿整理出版整工作，其中包括金岳霖先生的遗著《罗素哲学》、邓艾民教授的遗著《朱熹王阳明思想研究》等。

1995年初，致力于“智慧说”三篇（《认识世界和认识自己》、《逻辑思维的辩证法》与《人的自由和真善美》）的整理修改，直至3月1日去世。