为加强我校博士研究生创新能力的培养，鼓励博士研究生撰写高质量的学位论文，并为入选全国百篇优秀博士学位论文进行前期的准备，我校于2002年设立了优秀博士研究生培养基金。基金重点资助部分博士生选择创新性研究课题，进行高水平的科学研究。
    我校自2002年实施优秀博士生培养基金计划以来，共资助了189位优秀博士生，已取得初步的成效，多个项目的论文获得全国百篇优秀博士论文提名，更有一大批项目论文被我校推荐参加上海市优秀论文的评审。值得一提的是，2005全国优秀博士论文获得者：教育科学学院李政涛博士的论文《教育生活中的表演－－人类行为表演性的教育学考察》（2002年其项目“教育生活中的表演”获得优秀博士基金资助）。
    2008年度评选，全校共申报优秀博士培养基金项目127项。经院系推荐、研究生院组织专家盲审和专家最后复审，同意对教育科学学院等21个院系的64项研究项目进行资助。资助额度为文科8000元，理工科10000元。